Saç ekim operasyonunun ikinci temel aşaması, kanalların açılmasıdır. Kanalların açılması konusunda da, dikkat edilecek hususlar vardır. Kanallar, açılması gereken bölgede en doğru büyüklükte açılmalıdır. Aynı zamanda en doğru derinlikte açılması gerekmektedir. Çünkü bu durum, nakledilen saçların çıkma oranını etkilemektedir. Saç ekim yönteminde saç kökünün hem büyüklüğüne hem de uzunluğuna uygun kanalın açılmasına özen gösterilmek zorundadır. Saç ekim yönteminde, kanalın açısı da çok büyük önem arz etmektedir. En doğal görünümün elde edilebilmesi buna bağladır.